Soft R [01] Rで並列処理 ： Rのsnowパッケージを使った並列処理の簡単な例 [02] クリギング ： クリギングを使ったアメダスデータの空間補完の例 [03] スロットの利用 ： shapefileデータからスロット情報を抽出する例 [04] plotrixで作図 ： パッケージplotrixを使った作図 [05] 分位点回帰 ： 自作関数と組込関数で分位点回帰の勉強 [06] 主成分分析 ： 主成分得点による配置と主成分負荷量 [07] 地理的加重一般化線形モデル ： 離散データに対する地理的加重回帰 [08] クロス集計 ： CrossTable()によるクロス集計の作成 [09] 比率の信頼区間 ： いろいろある比率の信頼区間計算法 [10] 標準正規密度の面積 ： 標準正規分布の密度関数の塗りつぶし [11] 加法比例ハザードモデル ： スプラインを用いた加法比例ハザードモデルの推定 [12] データフレームの結合 ： 2つのデータフレームの共通変数をキーに結合する [13] カラーパレット ： カラーパレットによる塗分け地図の作成 [14] semで重回帰 ： 重回帰モデルをsemで推定(パス解析) [15] 多項式基底ベクトル自動生成 ： 次数qを与えて多項式基底ベクトルのRスクリプトを生成 [16] 地理空間データの読込 ： Rによるシェープファイルの読込 [17] 地理空間データの可視化 ： Rによる色々な地図作成 [18] 地理空間データの分布パターン ： Rによる空間自己相関や集積性の分析 [19] 地理空間データの回帰モデル ： Rによる空間自己回帰モデルと地理的加重回帰モデル [20] ggplot2入門 - qplot() ： ggplot2のqplot()の基本的な使い方 [21] CRSクラス ： PROJ.4に基づくRの座標系ライブラリのクラス [22] 多重比較(1) ： FWER(Familywise Error Rate)とFDR(False Discovery Rate)の調整p値 [23] 総称型関数 ： Rの関数のソースコードを見る [24] 生存時間解析 ： 指数, ワイブル, コックスによる比例ハザードモデル [25] lavaanパッケージでSEM ： semパッケージよりモデル式の記述が簡単 [26] 決定木(1) ： mvpartパッケージでCARTを実行 [27] random Forest ： randomForestパッケージでCARTに基づく機械学習 [28] 決定木(2) ： partyパッケージで決定木（回帰木・分類木・生存木）を実行 [29] Cox回帰の残差分析 ： Cox-Snell・マルチンゲール・最大対数尤度比残差，影響度 [30] Fractional Polynomial ： Fractional Polynomialでコックス回帰 [31] 自作のクロス集計関数 ： table()に相対度数と周辺度数を追加 [32] ロジスティック回帰のROC曲線 ： epicalcパッケージを使ったROC曲線 [33] 経時データの図 ： 経時データに対する個体別折れ線グラフ [34] 拡張コックス回帰 ： 時間との交互作用を時間依存共変量にもつコックス回帰 [35] 区分的指数ハザード ： 区分的指数ハザード＝ポアソン回帰＝コックス回帰 [36] ダミー変数 ： カテゴリ変数のダミー変数化 [37] 閉領域内外の判定 ： ある座標がポリゴン(閉領域)内外のどちらにあるかを判定 [38] 文字列の実行 ： 文字列をRのコマンドとして実行する [39] 人年の計算 ： カテゴリ別に層化して人年を計算する [40] 3次元散布図 ： rglパッケージで3次元散布図の作成とweb出力 [41] ポアソン回帰 ： ポアソン回帰と超過分散への対処について [42] 多重比較(2) ： 一般化線形モデルにおける平均の多重比較 [43] データ変換 ： 縦長データと横長データを相互変換 [44] 多重比較(3) ： 回帰係数の多重比較 [45] 緯度・経度・標高の取得 ： Google APIを利用して住所から位置情報を経度・経度で取得 [46] ルート距離 ： Google APIを利用してルート距離を計算 [47] 2地点間の標高 ：Google APIを利用して、2地点間を結ぶ直線の標高を取得 [48] 固定長データの読込 ：列幅の指定して固定長形式のテキストデータを読み込む [49] SEERデータの読込 ：SEERで提供されているテキストデータをRで読み込む [50] クロス表の平均 ：クロス表におけるセル毎の平均を計算 [51] ピボットテーブル ：Excelのピボットテーブルにような表を作成 [52] ubuntuでR ：ubuntu 12.04 にRをインストールする手順メモ [53] Rの並列化（doMC） ：doMCパッケージを用いて指定したCPUコア数にタスクを分割 [54] Rの並列化（doSNOW） ：doSNOWパッケージを指定したCPUコア数にタスクを分割 [55] SQLに対応するRスクリプト例 ：よく使うSQLに対応するRスクリプトの例s [56] Rのproxy設定 ：大学等でproxy環境でRを使うときのメモ [57] 回帰係数の値を固定 ：一部の回帰係数の値を固定して適合する方法 [58] 累積ロジットモデル ：順序カテゴリデータに対する累積ロジット(混合)モデルの適合 [59] 比例オッズモデル ：MASSパッケージのpolr関数で比例オッズモデルの適合 [60] GISデータの可視化 ：shapeファイルの属性情報をGoogleMap等で可視化 [61] Wordへの変換 ：RmdファイルをPandocを用いてWordへ変換 [62] chunkオプション ：Rmdファイル作成時のchunkオプション [63] RでTeX ：RのSweaveでTeXを利用 [64] dplyrでデータ処理 ：dplyrパッケージはレコード数の多いデータの処理を高速に行う [65] カラーキー付図 ：latticeパッケージでカラーキー，latticeExtraパッケージで重ね書き [66] 地図データの結合 ：複数のshape形式の地図データを1つに結合する [67] ポリゴンの内点判定 ：ポリゴンの内点判定を行い，内点データに対して各種統計値を計算 [68] 点と曲線・ポリゴンの距離 ：点と曲線またはポリゴンの最短距離を計算 [69] spクラス ：Rで空間データを扱うための基盤となるspクラスデータの作成と操作 [70] 多次元分割表 ：xtabs関数とftable関数で手軽に多次元分割表 [71] Rでxlsxファイルの読み込み ：エクセルファイルの複数シートからデータをRに読み込む [72] Rでxlsxファイルの読み込み（JAVAなし） ：openxlsxパッケージでJAVAなしで読込 [73] Brunner-Munzel検定 ：正規性と等分散の仮定しない対応のない2群比較の検定 [74] Spaghetti Plot作図 ：経時データにおける個体別折れ線（spaghetti plot）を作図 [75] %in%の否定 ：%in%の否定を判定する関数 [76] survfitの挙動 ：簡単な擬似データでsurvfit関数の挙動を確認 [77] 欠損地域の色塗り ：属性値欠損の地域がある場合の地図データの可視化 [78] ポリゴンの融合と共通部分 ：複数個のポリゴンの融合や共通部分のポリゴンを求める [79] bbmleで最尤法 ：optim関数等のwarpper関数を使った最尤法の実装 [80] 重み付き統計値 ：重み付き平均、分散、分位点などを求める関数群 [81] ガンマ分布 ：glm関数におけるガンマ分布の扱い [82] Rからe-Statデータ取得 ：e-StatのデータをAPIにより取得する [83] lavaanからsemへ変換 ：lavaan仕様のモデルをsem仕様のモデルに変換 [84] 地点間の距離 ：地点間の距離を計算する２通りの方法を紹介 [85] スクリーンショット ：Rでウェブページのスクリーンショットを撮ってファイル保存 [86] Googleスプレッドシート ：GoogleのスプレッドシートのデータをRにインポート [87] Fisher正確検定の多重比較 ：p.adjust関数にあるp値調整法でFisher正確検定の多重比較 [88] ベクトル対応Switch関数 ：hutilsパッケージのSwitchは入力値がベクトルに対応 TeX関係 LatexBox2e ： TeXをPowerPoint(2007以降)に貼り付けるためのアドイン，日本語対応 蝶々 ： TeXをPowerPoint(2007以降)に貼り付けるためのアドイン，動作が早い TeXCrop ： 日本語も使えるTeXで数式画像を作成するWebアプリ TeXsword ： TeXをWordに画像として貼り付けるためのアドイン MathType ： Word, PowerPoint対応の数式エディタでTeXコマンド変換も可能なアドイン Online LaTeX Equation Editor ： ブラウザ上でTeXから画像に変換 その他 グラフデータベース ： 国立がん研究センターがん対策情報センターによるがん情報サービス